Classificazione degli amminoacidi

Gli amminoacidi classificazione si basa principalmente sulle proprietà delle loro catene laterali:

1. Amminoacidi con catene laterali idrofile e cariche: Carica positiva: Arginina $Arg, R$, Lisina $Lys, K$, Istidina $His, H$ Carica negativa: Acido aspartico $Asp, D$, Acido glutammico $Glu, E$
2. Amminoacidi con catene laterali polari ma prive di carica: Serina $Ser, S$, Treonina $Thr, T$, Asparagina $Asn, N$, Glutammina $Gln, Q$
3. Amminoacidi con catene laterali apolari $idrofobiche$: Alanina $Ala, A$, Valina $Val, V$, Leucina $Leu, L$, Isoleucina $Ile, I$, Metionina $Met, M$, Fenilalanina $Phe, F$, Tirosina $Tyr, Y$, Triptofano $Trp, W$

Highlight: La glicina $Gly, G$ e la prolina $Pro, P$ sono casi speciali con caratteristiche uniche.

Example: La cisteina $Cys, C$ può formare ponti disolfuro $-S-S-$ con un'altra cisteina, influenzando il ripiegamento della proteina.

Gli amminoacidi polari e apolari hanno un ruolo cruciale nella determinazione della struttura e della funzione delle proteine.

Vocabulary: Ponte disolfuro - Legame covalente tra due atomi di zolfo di residui di cisteina, importante per la struttura terziaria delle proteine.

La struttura ionica dipolare degli amminoacidi

Gli amminoacidi presentano una struttura ionica dipolare, detta anche zwitterionica, dovuta alla presenza del gruppo carbossilico e del gruppo amminico. Questa struttura si forma attraverso una reazione intramolecolare acido-base:

1. Il gruppo carbossilico $-COOH$ si comporta da acido, cedendo uno ione H+
2. Il gruppo amminico $-NH2$ si comporta da base, accettando lo ione H+

Definition: Zwitterione - Ione con due cariche opposte su due gruppi funzionali diversi della stessa molecola.

La struttura ionica dipolare influenza notevolmente le proprietà fisiche e chimiche degli amminoacidi:

• Proprietà fisiche: stato solido cristallino, alti punti di fusione, solubilità in acqua ma non in solventi apolari
• Proprietà chimiche: comportamento anfotero $possono reagire sia con acidi che con basi$

Vocabulary: Anfotero - Capacità di una sostanza di comportarsi sia da acido che da base a seconda dell'ambiente in cui si trova.

Il punto isoelettrico amminoacidi è il pH al quale la molecola ha carica netta zero, ed è una caratteristica importante per la separazione e l'identificazione degli amminoacidi.

Highlight: In soluzione basica gli amminoacidi si comportano da acidi cedendo un protone, mentre in soluzione acida si comportano da basi accettando un protone.

La comprensione della struttura ionica dipolare è fondamentale per capire il comportamento degli amminoacidi in diverse condizioni fisiologiche e il loro ruolo nella formazione e funzione delle proteine.