duplicazione dna

Didascalia alternativa:

proteina é radioattiva ma il batterio no M² D Lo mischiano con dei batteri e centrifugano Lola proteina non è radioattiva ma il batte= rio si 8 ordinato perfettamente in modo lineare da Wilkins 1953 Watson e Crick trovano la struttura del DNA grazie ai risultati della cristallografia della Franklin, agli esperimenti che dicevano ci fossero 2 catene affiancate e opposte e dagli esperimenti delle basi azotate. basi ↑ MODELLO AD ELICA = 2 catene complementari e parallele Il diametro dell'eli ca è sempre costante له 3¹ 5' Frammenti di, DNA nuovi 3' Il DNA si pensava si duplicasse in 3 modi: -SEMICONSERVATIVO: ciascuna molecola contiene 1 filamento vecchio ed I nuovo -CONSERVATIVO: molecola è uguale alla vecchia ed I uguale alla nuova -DISPERSIVO: Origine di molecole di DNA "mischiate" ور - Ogni catena è una sequenza di nucleotidi -Le catene sono complementari = A-PT (2 legami C-G (3 legami a a -Sono antiparallele: da un estremità abbiamo 5'e dall'altra abbiamo 3' e nel nucleotide opposto viceversa Doppia elica perché sono 2 filamenti DUPLICAZIONE DEL DNA Kornberg fece un esperimento ma non basta per scoprire come avvenisse la duplicazione DUPLICAZIONE SEMICONSERVATIVA: Ha bisogno di cose specifiche nucleotidi trifosfato, = un DNA già esistente ed un primer (nucleotidi iniziali) Awiene per tappe = Despicalizzazione, si come pono i legami a idrogeno tra le basi azotate ed i suoi filamenti si separano; Appaiamento, la DNA polimerasi fa si che i filamenti separati si uniscano con dei filamenti in crescita, creati in base alle basi azotate اما 3' www.m legami tra i nucleotidi sono legami a idrogeno Frammenti di Okazaki Direzione di de= spiralizzazione idrogeno) idrogeno) È necessario che si creino dei primer per far continuare il filamento 2) Si crea il primer 1 sola volta e da lí conti= nua POLIMERASI E un enzima che inserisce i nucleotidi completando gli altri Non inizia il filamento perché lo fa la primasi (fatta di RNA), poi eliminato e sostitui= to dalla polimerasi che completa fino all'ultimo nucleotide, legato poi dalla ligasi SEQUENZA TELOMERICA: 11 cromosoma arriva alla fine e deve eliminare i primer; in un filamento toglie i primer e la polimerasi mette il DNA mentre nell'altro rimane un buco, che viene poi tagliato ed il cromosoma si acco (invecchiamento) Lotelomero Nelle cellule staminali e tumorali ci sono le telomerasi che creano altri frammenti di Okazaki finche non finisce il filamento DNA ed ERRORI: Ogni volta che il DNA si duplica si sbaglia qualcosa b Ora c'è errore su un miliardo, quindi 60 errori, ma sono ancora troppi quindi rilegge tutto e se c'è un pezzo sbagliato di nucleo= + tidi la polimerasi ricrea il filamen to e la ligasi lo lega II DNA si puo danneggiare anche con radiazioni ed in caso la cellula rileggendo tutto in futuro sistema tutto Le polimerasi si sbagliano 1 volta ogni 1'000'000 però noi abbiamo miliardi di cellule quindi ci sarebbero 60'000 errori, riparati con 3 meccanismi: -Correzione di bozze (proofreading), torna indietro e cor regge -Riparazione di anomalie di appaiamento (mismatch re= pair), esamina subito la copia del DNA e corregge gli appaiamenti - Riparazione di escissione, rimuove le basi anomale causa= te da un agente chimico e le sostituisce con basi fun= zionali ORGANISMI MODELLO Gli organismi modello per ora sono stati il pisum sativum (Mendel) e la drosophila melanogaster (Morgan), adesso aggiungiamo la neurospora crassa, un fungo aploide facile da coltivare 1958: Beadle e Tantum ipotizzano che dall' espressione dei geni esce il fenotipo LoFanno crescere la neurospora crassa in vari terreni di coltura (terreni minimi) ↓ ↓ La neurospora sopravvive e la bombardano di raggi X: -CEPPO = sopravvive solo con l'arginina • CEPPO 2 = soprawive con l'arginina e con la citrullina precursore. Domiting-citrullina-arginina • CEPPO 3= Soprawvive con tutte le sostanze Lose Il DNA dovrebbe uscire dal nucleo per di= ventare una proteina ma non può quinoli Crick si fa 2 domande: •Come passa dal nucleo •Come il DNA e la proteina re" (traduzione) minimo necessario in cui crescere Ceppo 2 ENZIMA B Ceppo d ENRIMA C Ceppo 3 ENZIMA A si Iva a mutare una parte del DNA si va a mutare un enzima prodotto e da qui nasce il det= to "un gene, un enzima" Lo cio` viene poi modificato perchè un gene crea il progetto di un polipeptide, quindi nasce "un gene, un polipeptide", quindi il gene esprime il polipeptide Per esempio l'emoglobina: trasporta l'ossigeno dai polmoni ai tessuti 4 polipeptidi = 2 catene di tipo alfa (<) e 2 catene di tipo beta (B) DAL DNA ALLA PROTEINA Non tutto il DNA viene espresso però, quindi alev= ni geni si esprimono controllando altre sequenze di DNA • Ipotizza che ci fosse un "messaggero" (trascrizione) citoplasma? 4 si scambiano i geni con alfabeti diversi? -Ipotizza che ci sia un "adattato= mRNA: É I'RNA messaggero che però non può far passare i geni dalla proteina al DNA Log Dopo aver passato il messaggio serve tra= durlo con una molecola adattatrice LORNA transfer (tRNA) Diviso in 2 estremità: 1ª estremità che legge 2ª estremita che traduce DNA Esiste per sempre tranne che per la trascrizione 2 filamenti legati ad idrogeno Lo zucchero è il de: ossiribosio (D) Ci sono Adenina, Guanina, Citosina e Timina RNA Esiste per poco tempo 1 unico filamento Lo zucchero e il riz bosio (e) Le basi azotate sono diverse: Adenina, Guani na, Citosina ed Uracile (struttura simile alle Timina) ribosomi LoCi sono dei geni chiamati housekeeping che vanno trascritti sempre, altri invece vengono trascritti in base alla zona del carpo ed al bisogno TRASCRIZIONE EUCARIOTE: Non è regolabile da 3 TERMINAZIONE L'RNA polimerasi arriva alla fine e si ON ed off; in base ai diversi fattori di tras: crizione una cellula diventa di un certo tipo stacca quando arriva a delle sequen ze di terminazione sono dei virus (retrovirus) che lo fanno grazie ad un enzima => TRASCRITTASI INVERSA ↓ Come I'HIV, da mRNA diventa DNA mm m m m m m m AUG AGU GGU CCG CAG AUG UGU UAG RNA = acido ribonucleico Lo 3 tipi: mRNA, tRNA ed RNA ribonucleico che viene dai ribosomi -D DNA-mRNA LA TRASCRIZIONE: E simile alla duplicazione ed è suddivisa in 3 tappe: INIZIO = Ha bisogno di un primer, che si lega all'RNA po= limerasi; quindi i primer dicono all' RNA polime- rasi l'inizio della trascrizione, la direzione e qua le filamento trascrivere ALLUNGAMENTO= L'RNA apre il DNA e legge il filamento in verso 3-5¹; L'RNA è uguale al DNA complementare ed opposto all'altro LA TRADUZIONE: L'RNA viene letto e tradotto in amminoacidi DNA HITOCONDRIALE E uguale al DNA mitocon= driale delle nostre madri quindi è quasi u= niversale Si ottiene il trascritto primario che deve pero es = sere trasformato LL'RNA he 4 lettere mentre gli amminoacidi sono 20 quindi ogni 3 basi si "crea" un amminoacido Locodone Il primo amminoacido delle proteine é sempre AUG (metionina) mentre l'ultimo c'è un codone di STOP che può essere UAA, UAG oppure UGA, in cui non si abbina nessun aminoacido e quindi si stacca ✓ Ci sono quindi 64 codoni che pero sono troppi rispetto ai 20 amminoacidi Si capisce quindi che ci sono + codoni per 1 am minoacido => rindondante (non é ambiguo perché solo 1 amminoacid ma un ammi = noacido da più codoni un codone