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le biomolecole

19/12/2022

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LE BIOMOLECOLE Sondamentali per ea vita Le biomolecole sono sostanze organiche presenti negli organismi viventi Sono costruite gondamentalmente da CARBONIO, Ossigeno, IDROGENO e AZOTO. Le biomolecole sono: CARBOIDRATI, LIPIDI, PROTeine, ACIDI nucleici • GRUPPI FUNZIONALI: piccoei raggruppamenti di atomi in cui ogni gruppo ha proprietà chimiche Specifiche carbonio OSSIDRILE R-OH CHO ALDEIDE R-CO H Amminico H R-NTH OH CARBOSSILE FOSFATO R-C3 8 R-O-P-O- CHETOone O R-Ċ-R sono composti carboniosi (contengono le carbonio) GLUCIDI composti TERNARI di 3 elementi chimici carboidrati 2 : Cn (H₂O) n 1. POLIDROSSI ALDEIDI costituite da carbonio, idrogeno e ossigeno (+ a2oto) VALENZA: numero di legami che si costruisco no quasi uno per ogni carbonio ACQUA: H IDROSSI → hanno il gruppo ossidriee -O-H 2. POLIIDROSSI CHETONI con eegame covalente polare 02: carica neg. LEGAMI INTERMOL. DEBOLI ponte H FORTI: eegami covalenti SH: canca pos. GRUPPO ALDEIDICO POLIIDROSSIALDEIDÍ (gencosto rossialderdico) H НО gruppo CHefonico 6 non ha mai le 1° carbonio nee gruppo Chetonico a diggerenaa deel' alderdico ↓ sempre sue 10 CH₂ -0 H-C-OH OH-C-H I ОН Н H-C-OH POLIIDROSSICHETONI (gruttosio H H-C-OH OH H-C-OH H OH GLUCOSIO 0 CH₂_0. 1 H HO Hanno entrambi la stessa gormula bruta (esosi) C6H₁2O6 Dunque FRUTTOSIO e GLUCosio sono isomeri ↓ ISOMERI > molecole con struttura diverša ma stessa formula bruta carboniee OH 6 carboni MOLECOLA →12 idrogenl GLUCOSIO ↳ 6 ossigeni HO-C-H OH H FRUTTOSIO S SI Scrive non ha mai CH₂OH le 1° carbonio →>>> CH₂OH H-C-OH C=O I → CH₂OH H-C-OH H-C-OH pollidrossichetone) 6 carboni molecola 12 idrogeni FRUTTOSIO ↳ 6 ossigeni H-C-OH CH₂OH poelidrossialderdi e chetoni quando hanno una catena carboniosa 4 CARBONI, si trovano chiusi ad ANELLO maggiore di ● MOLECOLE AD ANELLO DEL GLUCOSIO esagonale H \ C(4) H-C₂OH OH-CH H-C-OH H-ĆÍ OH но о-н H C=O HO-C- I C-OH Regaione chimica tra le gruppo ALDEIDICO ele Penultimo CARBONIO I Сон CH₂OH l'ultimo carbonio e fuori daee aneelo H₂O O OH OH • MOLECOLE AD ANELLO DEL FRUTTOSIO pentagonale CH₂OH OH X1) Quando un geucide chiude la sua molecola ad anello Comple una reazione intramol in cui coinvolge sempre e'ossidrile dee penultimo carbonio A) MOKOSONCARINI OSSIDRILE SOPRA= B OSSIDRILE SOTTO= α viene usato le penultimo assidriee con le gruppo Chetonico monoSACCARIDI Sesosi 6 CARBONI •Glucosio fruttosio galattosio pentosi 5 CARBONI -ribosio -desossiribosio costituiti da...

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Didascalia alternativa:

singole molecole legate con A) MONOSACCARIDI: PONTE IDROGENO (tra basi azotate) B) DISACCARIDI : legami tra due auccheri monosaccarıdı C) OLIGOSACCARIDI: Costituiti da 3 a 10 monosaccaridi D) POLISACCARIDI: da più di 10 monosaccardi COVALENTI LEGAMI GLUCOSIO || esagono perche ci Song 5 carboni e 1 ossigeno, mentre l'ultimo carbonio è sempre guori B) MALTOSIO DISACCARIDI Si ricava dae MALTO Sincovo doe MALTOD SACCAROSIO riducenti non riducente MALTOSIO: è un disaccaride con 2 molecole legate Covalentemente, ossia una molecola di a glucosio e una di ß glucosio (con legami 14 glicosidico). formato da 2 KHI KHÍ MaecoE CHÍNH na legami do 1 92 da no l'ossidne 40 possione Si chiama GALATTOSIO 101 cartoonia Oli anello RILUCENT CHOH PH CHOI Ca Ch 0 Made In alcould mende forme 3 SACCAROSIO è un disaccaride non riducente ¡ formato da una molecola di a glucosio e una di Pruttosio legate da legame (1→2) glicosid. NON RIDUCENTE FRUITOSIO pentagono perché le secondo e le penultimo si uniscono e le to resta sempre guori (OLIGOSACCARIDI) Isomeri Figura 16-22 Il saccarosio è un tipico disaccaride non riducente aucchero barbabietole LATTOSIO GALATTOSIO (1 Ra l'ossidrile in su alla 4° posizione LATTOSIO disaccaride Con una molecola di galatoslucosio con e una molecola eegame ³ (1 >4) glicosidico aucchero barbabietole POLISACCARIDI OAMIDO 2 GLICOGENO 4 AMIDO: forma polimerica formato da unità di a Glucosio (posizioni 1-4) legati da legami covdeenti Malecela di cas 3 AMILOSIO @AMILOPECTINA formata da due CAMILOSIO: polimero costituito parti molecolari polisaccaria da catene lineari di unità di glucosio ↳eegame glicosidico 1-4 AMILOPECTINA: polimero ramificato da catene di molecole di glucosio ↳eegame glicosidico 1-4 CH₂O Qad @ GLICOGENo gorma polimerica formato da unita di a Glucosio (posizioni 1-4/1-6) CH,OH eegami da 184 CH,OH POLISACCARIDI cellulose CELLULOSA CH,OH OCHITINA CHOR SCELLULOSA forma polimerica Gormata da unită diß GLUCOSIO con eegami glicos. (14) ACIDI URONICI a 16-23 La cellulosa è un pelimero del 1-alucosio CARATTERISTICHE: nei muscoli, segato è una riserva di GLUCOSIO & • è simile all' AMILOPECTINA (nell' amido) ↓ per separare basta IDROLIZZARE un 'po' di idrogeno ha ea gunzione di sostegno delle plante 6 CHITINA CH₂OH OH NHCOCH, CH.OH CHO HOH OH ACIDI URONICI HOH HOH a H-OH COOH Acido glucuronico 0 ANH COH A2OTO Chitina CH,OH OH a 16-25 La /chitina è un polimero della N-acetil-D-glucosammina. presenza aaoto COCH3 glucosio NHCOCH. ZUCCHERO A2OTATO. QUATERNALE H polimero che ha come monomero N-acetie D-glucosammina unite da legami ß (134) gli cosidici. COCH3 DESTROGIRO CO-H COOR ACIDI URONICI→ (43) glicosiatico molecola detta Acido glucuronico с1 0 03 НО Si trova: heeea corazza esterna dell' esoscheletro degli antropodi (animali delle pendici articolate) neeea parete delle cellule dei funghi CH,OH - Unità di acido ialuronico (più importante mucopolisaccaride). Struttura di un composto detto AMMINA • molecola versione ß (verso l'alto) assomigliano al glucosio- sono esag. ma hanno l'ammină. ● eteropolisaccaride con legame B N-acetilglucosamina NH COCH ra 16-15 Gli acidi uronici sono i costituenti dei mucopolisaccaridi, che si tro- vano nei tessuti connettivi, nel fluido sinoviale, nell'umore dell'occhio, etc. ac. uronia solo il gruppo alcoolic's primaris terminale é ossidato a curbussill le re dei mucoPOLISACCARIDI è e' ACIDO IALURONICO, sempre presente nei tessuti connettivi è un ETEROPOLISSACARIDE (quando una catena gluci // POUSACCARIDE Bå und ripetizione in alternanaa) neee' acido ialuronico di N-ACETYL... ACIDO GLUCURONICO molecoea simile al glucosio che in coda alla struttura della molecola ha le GRUPPO CARBOSSILICO (COOH) <rilascia loni posivi PEPTIDOGLICANI Polimeri costituiti da proteine e auccheri, sono eteropolisacc. perchè costituiti da due monomeri → ß(1-4) • parete deeea ceeeuea batterica & Organismi unicellulari x=naceul glucos y-acido murami CH,OH NHẠC KH PEPTIDOGLICANI (nell'acido ialur.) m CH,OH \ NHUOCH CHÍCH CÓ peptide CH,OH OH CH,OH NHCOCHA o rimane o NHONH KH TO in 16-26 Le catene polisaccaridiche dei peptidoglicani dei batteri sono formate dall'alternanza di una molecola di N-acetilglucosammina e una molecola di acido N-acetilmurammico. NH LEGAME GLICOSIDICOM eegame tra molecole monosaccaridi che si ganno con una dinamica di condensazione enzimatica Ki ОН HO Possono essere definiti: • α GLICOSIDICO se parte da una molecola x B GLICOSIDICO eegate da enaimi al cettute procarioti. abbiamo due monomeri •N ACETIL MUR AMMICO ✓ PRINCIPALI POLISACCARIDI AMIDO 2 GucoGeno n-acetie-glucos + parte proteica • N-ACETIL GLUCOSAMMINA Le Funzioni PRINCIPALI Sono: RISERVA ENERGETICA, FORNISCONO SCHOLETRI CARBONIOSi e MATERIAL STRUTTURALI per le sosteano delle cellule > Si elimina H₂O faciemente idrolizzabili in monomeri di glucosio CELLULOSA: polisacc. del glucosio iegato tramite legami ad idrogeno 4 CHITINA: polisacc. dele' aceti@glucosammino ACIDI nucleici: sono molecoee gatte da unità che si ripetono →→ POLIMeRi gatti da monomeri detti nucleotid (Ranno il gruppo fosfato) BASI A2OTATE dee DnA⇒ adenina, guanina, timina e citosina • BASI A2OTATE deel' RnA = adenina, guanina, uraciée è citosina T RNA ↓ ricopia e' informazione contenuta nee DNA eea trasporta nee citopeasmă (le traduce) singolo Reamento su se stesso, gatto da catena di molecole di ribosio legate da ponte idrogeno DNA → doppio gleamento su se stesso, gatto da molecole di desossiribosio legate da ponte lanogeno (eegami H) + gruppo gosgato si trova nel nucleo di tutte le cellule e contiene ee ingo per le gunaionamento ceeeueare ● ACIDO RIBONucleico: costituito dal ribosio che ha un atomo di 0₂ in più dee desossiribosio RIASSUmenoo: sono gormati da 1) uno ZUCCHERO → desossiribosio ↳riboso 2) UN GRUPPO FOSFATO 3) una BASE A2OTATA PROTEINE Sono POLIMeRi Sormati da monomeri ai AmmINOACIDO le eegame chimico che eega gli amminoacidi e le eegame peptidico (covalente) Tegame covalente che avviene tra c-O e N-H di que amminoacidi, con espulsione di una molecola di acqua Funzioni DeLLe PROTEINe i ... DOD DO Doruntinl 1) Structurate (x parul dee curpu: Cheratina) 2) Contrattiee (x contrazione muscoeare) → ACTINA e MIOSINA 3) enamatica (accellerano le reazioni chimiche) di trasporto (spostano le sos. nee corpo) ou riserva (gonte di sos. nutritive) ma soprattutto: nutrimento a 3) trascrizione dei caratteri genetici ⇓ tutte le proteine TRADUCono le INFORMAZION) dei -Geni STRUTTURALI porzioni di programma genetico con ee informazioni per gare le proteine dal LINGUAGGIO delle BASI AQOTATE linguaggio degei ACIDI nuc LETCI DNA: I (timina) A (adenina) comune G (guaninas al -C (citosina) ✓ RNA: u (uracele) dicono tutto quello che c'e' dentro le compo umano ee triplette sono 61 per una 20 di amminoaciou Sono in glo00 due linguaggi: LA NATURA PRENDE GRUPPI DI 3 BASI ALLA VOLTA→ Combinazioni totali 43=64 tutte le sigle degli amminoacion + de LINGUAGGIO delle PROTEINE 11 La natura ha costituito un CODICE Generico ► corrispondenza tra triplette e amminoacidi più combinazioni per un solo tipo di amminoacidi linguaggio deeea sequenza amminoacide e'errone riparano UUU UUC UUA UUG CUU CUC U GUC GUA GUG phe ley CUG AUL AUC AUA AUG met UCU UCA UCG val CAU CAC FLODE BADE BALLERMA CCG TE LEUCOU CAG AAU AAC AAA AAG GAU GAC le ACC ACA ACG GCU GCC GCA GCG the UAU ala JAA LIAG GAA GAG STOP N asn lys asp UGU UGC UGG SOU CGA arg A CGC CGG G AGU AGA AGG GGU GGC GGA GGG ser U A G U с AMMINOACIDI: composti da GRUPPO Amminico GRUPPO CARBOSSILICO - coo (ha perso 1H) -NH3 esempio: GLICINA → sono legati da un carbonio Condensaalone: processo che elimina enaIMATICA molecola d'acqua per ogni coppia che si unisce per reazioni di condensaalone, IDROLISI: processo che prevede l'aggiunta di una molecola d'acqua per ogni coppia di monomeri che si separa amminico (NH2) H 1.32 A a ↓ H N-C-C I H APOLARI BASICI ACIDI LEGAME PEPTIDICO 1.24k sottrazione di H₂O Rs H Te gruppo R varia per ogni amminoacido: sono presenti 20 amminoaciai. (tipi diversi) Te gruppo gunzionale è diviso in 4 categorie: -POLART N Il legame peptidico è rigido e planare (b) Solo Si puomo behis care carboni a H O OH O OH Carboxyl terminus e v sono di 180° quando il polipeptide è nella conformazione complanare estesa e tutti i gruppi peptidici sono sullo stesso piano. carbossilico assumere tutti i valori compresi tra -180° e +180°, ma molti valori ey posnihiti per interferenze steriche tra gli atomi dello scheletro del polipeptide risultano i per e quelli delle catene laterali. coinvolge le c del gruppo carbossilico e l'N dee gruppo amminico C H H. GRUPPO Funzionale (R) Ra N-C 1 H OH Si toglie H₂O = Condensaaione enamatica →ie 21G 2AG deeea catena: IBRIDA2ione ATOMI CARBONIO e A 2010 ee proteine ruotano attorno a dei legami ma non ruotano mai attorno al legame peptidico CLASSIFICAZIONE AMMINOACIDI IN BASE AL RESTO R Aminoacidi con R non polare COO™ çoo™ C-H + H₂N-C- H Glicina COO™ + H₂N-C-H I CH₂ I CH + H₂N- H₂N-C-H I CH Alanina coda Idrocarb. çoo + H₂N-C-H 8-³-6-5-«-5ª H-C-CH3 H₂N-C-H + 900- CH₂ CH3 CH Leucina Isoleucina trapolare Aminoacidi con R polare + H₂N-C-H CH 2 H₂N My CH₂ CH3 Valina CH Serina Treonina Cisteina çoo- HAN CH2 T ·CH ₂ Prolina çoo çoo çoo + + + H₂N-C-H H₂N-C-H H₂N-C-H CH₂OH H-C-OK I CH₂ SH->2010 COO™ TH arbonile 3 H çoo + T N-C-H CH₂ CH₂ ć /\ Aminoacidi con gruppi aromatici çoo çoo çoo™ + H₂N-C-H I CH₂ +1 H₂N-C-H CH₂ Fenilalanina APOLARE + 700- H₂N-C-H CH₂ •AMMINOACIDI POLARI •(• ossianée (gruppo OH) CH₂ +NH3 tra polare e apol Aminoacidi con R carico posit. coo Coo H₂N 0 Metionina Asparagina Glutammina +1 H₂N-C-H OH Tirosina POARE Triptofano CH ₂ CH ₂ CH ₂ CNH2 NH₂ Lisina Arginina (> meno elettron. dell' ossig. COO™ + H₂N-C-H CH ₂ COO™ Ac. aspartico + H₂N-C-H H₂N- çoo + H₂N-C-H I CH₂ C=CH + H₂N-C-H I CH₂ NH CH ₂ I CH₂ COO™ Ac. glutammico Donika tr H Triptofano -NH วารอน เจน a a g чуи оп solo nella catena idrocarburica→ Struttura formata da un carbonile eegato a un gruppo amminico • AMMINOACIDI APOLARI ✓ Si trovano solo: • CARBONI IDROGeni H HA IL RESTO DELLA GLICINA → Ra solamente H N-C7C² CARBONIO CHIRALE (o carbonio a) Y-Ca- 2 O OH w auifuсии due parti idrocarburiche NH è dunque un RESTO IDROCARBURICO neela glicina le carbonio non e CHIRALE ↓ eega 4 parti chimiche diverse, dette SOSTITUENT Ingatti Sa eegami con 2 parti chimiche uguali Gli idrocarburi apoeari non sono sœublei in acqua perche sono formati tra carboni e idrogeni con legami non polarisaati BASSO TASSO DI POLARI22A2ione Sono a polari anche gli amminoacidi con i GRUPPI AROMATICI in un anello carbonioso si alternano un gruppo di atomi di carbonio in cui si alternano doppi legami • AMMINOACIDI ACIDI (sempre POLARI) nee resto R. c'è un altro gruppo carbossilico che non è quello solito (OH) COO = COOH AMMINOACIDI BASICI (sempre POLARI22ATO ) ▬▬ (gruppi amminici anche neeea versione caricata positivamente). Hanno nee resto. • NH₂ = gruppo amminico -NH3 = gruppo amminico loniaauto anello molto aaotato FORMA QWITTERIONICA doppio segno che rappresenta gli elettroni 1 tratto= 2 elettr I I HZ I-D-ON eegame Covalente dativo ● ZE- GR NI-C H Foinman H+ ione ACIDO L'atomo ha un 0+ (doppietto elettronico), non usati per i eegami, ma vengono impiegati per altri eegami S COO Si possono staccare gruppi Ht Cost le gruppo carbossilico diventa Coo- e lo lone Ht si lega all azoto in un legame covalente dativo ↓ STRUTURA STRUTTURA PRIMARIA SeconDARIA che e' aaoto dispone se qualcuno ha bisogno dee doppietto libero non impiegato in legame R L'amminoacido diventa allora un doppio lone NH3-c-Coo- H LIVELLI STRUTTURALI DELLE PROTEINE per definire le proteine • In che ordine sono disposti gei aa 1) PRIMARIA detta anche sequenaA AMMINOACIDICA o di residui ↓ amminoacidi quanti aa quali da STRUTTURA TERZIARIA COTONO MUDONTINICA STRUTTURA QUATERNARIA FOTINUINEU CATENA MULIPEPTIDICA 2) SECONDARIA. disposizione nello spazio di catene polipeptidiche con eegami idrogeno (in una sola direzione. doppio carbonie ne carbossile 3.6 residues/turn Carboxyl terminus struttura primaria Lys Lys Come IDROG gruppo amminico Gly Gly Leu Val Ala His residui amminoacidici a ELICA (IDROFILA) meninn 11 ● andamento a elica (come le DNA) moor 3) TERZIARIA Struttura tridimensionale complessiva (riplegamento di a ELICA OB FOGLIETTO) dopo la soe ea 2º si ripiega nella 3° dimensione conferisce elastiată e flessibilita •ogni elica e stabilizzato da PONTI IDROGENO tra I carbonili e gli (arogeni dee gruppo amminics struttura secondaria α-elica • STRUTTURA A GOMITOLO: andamento nello spazio tridimensionale deea catena struttura terziaria catena polipeptidica B FOGLIETTO (IDRO FOBA) andamento a 21G 2AG in • Struttura a planí ripiegati singola carena proteica in unione 'con un altra catena ß POGLIETTO ✓ sempre con pONTI IDROG A struttura quaternaria gruppo emė subunità associate gruppo CHIMICO eme della catena proteica deee' emoglobina On 20 proteica • STRUTTURA A SUPER ELICA: solo per ß FOGUETI LEGAMI STRUTTURA TERZIARIA PROTEINE La struttura delle proteine Struttura terziaria. Determinata da interazioni deboli (legami ad idrogeno, interazioni di carica, ponti disolfuro, interazioni idrofobiche). Due principali classi: Globulari mioglobina ZOLFO Fibrose LEGAME CH₂ COVALente Detro CH₂ T 4 LeGAMe Ionico: 1R con carica ponte disolfuro enaimático fra 2 ZOLFI H₂N collagene OH legame idrigeno 11 CH H₂C1 CH₂ forze di H₂C H CH Van der Waals O NH3 PONTE DISOLFURO tra gll amminoacidi con le gruppo SH nee resto R 1 PONTE DISOLFURO (resti R con gruppi SH) legame ionico Sono stati tolti que atomi di idrogeno (H₂) 3 INTERAZIONI IDROFOBICHE con R di tipo APOLARE nu sempre ea s STRUTTURA a GOMITOLO - TOROGENO: Stabilisce le Strutture teralarie R POLARI ma anche tra POLARE e ACIDO + NEGATIVA: resti acidi POSITIVA: resti basici TERZIARIA → legami solo tra resti R di amminoacidi • uno dei 4 tipi di legami • vero e proprio eegame Covalente DEIDROGENAaione gatta dagli enaimi deidrogenasi che generano eegami Covalenti IDROGENAZIOne → Genomeno contrario che reintrega idrogeno con gli enaimi idrogendisi STRUTTURA QUATERNARIA e un associazione di proteine, come e' EMOGLOBINA che si trovano insieme per suoegere ea propria gunaione Catene betal Catene alfa Gruppy eme contenenti atomi di ferro Testa (capside) Guaina Non tutte le proteine raggiungono, Questa Struttura: Piastra basale EMOGLOBINA 4 strutture teraları A GOMITOLO BOITERIOFAGO batterio composto da gilamenti (tanti gomitoli) e intercetta le programma generico deeea Celliea Fibra caudale } Coda una secondaria a a ELICA EME •contiene il suo gruppo Ra 4 atomi di gerro